Test cost: 0 Rial

Status of test presentation: Existing

Clinical information:

روش توالی یابی نسل بعدی (NGS):

NGS زمینه تایپ آنتی ژن لکوسیت انسانی (HLA) را متحول کرده است و روشی با توان بالا و دقیق تر برای شناسایی تغییرات در ژن های HLA ارائه می دهد. NGS قادر به تعیین توالی نوکلئوتیدی میلیون‌ها مولکول DNA به طور همزمان است و امکان تجزیه و تحلیل جامع‌تر و دقیق‌تر تنوع ژنتیکی را فراهم می‌کند.

روش NGS برای HLA typing شامل مراحل زیر است:

• استخراج DNA: نمونه ای از DNA از خون یا نمونه بافت بیمار استخراج می شود.
• آماده سازی کتابخانه: نمونه DNA قطعه قطعه شده و به انتهای قطعات آداپتورهایی اضافه می شود. آداپتورها به قطعات اجازه می دهند تا به یک تراشه توالی یابی متصل شوند و توسط PCR تقویت شوند.
• توالی یابی (Sequencing): کتابخانه قطعات DNA بر روی یک تراشه توالی یابی بارگذاری می شود و با استفاده از فناوری NGS توالی یابی می شود. توالی یابی میلیون ها قرائت کوتاه از داده های توالی DNA را ایجاد می کند. قطعات DNA تقویت شده بر روی پلتفرم توالی یابی نسل بعدی، مانند Illumina یا PacBio بارگذاری می شوند و توالی های نوکلئوتیدی هر قطعه از طریق روش های مختلف بسته به پلت فرم تعیین می شوند.
• تجزیه و تحلیل داده ها: داده های توالی با استفاده از نرم افزار تخصصی برای شناسایی آلل های HLA موجود در نمونه تجزیه و تحلیل می شوند. این نرم افزار داده های توالی را با یک پایگاه داده مرجع از آلل های HLA شناخته شده مقایسه می کند و نزدیک ترین تطابق را شناسایی می کند.
• HLA typing: نتایج آنالیز NGS برای تعیین نوع HLA بیمار استفاده می شود. این نرم افزار آلل های خاص HLA موجود در نمونه را شناسایی می کند و گزارشی از نوع HLA بیمار ارائه می دهد.

• فناوری NGS چندین مزیت را نسبت به سایر روش‌های تایپ HLA فراهم می‌کند. این امکان تعیین توالی کل منطقه ژن HLA را فراهم می کند و تایپ HLA جامع تر و دقیق تر را ارائه می دهد. همچنین می تواند آلل های نادر یا جدید HLA را که ممکن است با روش های دیگر شناسایی نشوند، شناسایی کند. با این حال، فناوری NGS پیچیده‌تر و گران‌تر از روش‌های دیگر است و به تجهیزات و تخصص تخصصی نیاز دارد.